Рис.2.А)Результат выданный программой Chromas. Как видно, поставлено N, так как пик от G соразмерен с пиком от С. B)Я заменила N на С, потому что это начало послдоательности после нечитаемого фрагмента, и пик для G примерно такой же высоты, как ближайшие шумовые пики. (например, пик G у 3-го А на этом изображении абсолютно такой же высоты

Рис.3.А) В данном случае я согласилась с анализом программы, посчитав высокий пик Т между G и А шумовым, так как иначе расстояние между нуклеотидами слишком маленькое.

Рис.4.А)Здесь 2 проблемных нуклеотида - 27, 28 И программа, хоть уровень сигнала от C нуклеотида даже превосходить В)Так как уровень 2-х сигналов совпадает, я решила, что это полиморфизм 2-х нуклеотидов. 27 - S, т.е. полиморфизм С и G, а 28 - M, полиморфизм С и Т.

Рис.5.А)Программа поставила здесь N В)Я же считаю, что хотя сигнал от C только в два раза меньше, чем сигнал от G, то тут имеет смысл поставить G, потому что соседние точно шумовые пики примерно такого же размера.

Рис.6.А) в данном случае пики у нуклеотида 342 и между нуклеотидами 350 и 351 одинаковой высоты и принадлежат одному нуклеотиду - G. B) Однако, я считаю, что в одном случае это шум, а в другом сигнал от правильного нуклеотида, так как расстояние между двумя А (341 и 343) будет тогда слишком большим. А с шумовых пиком как раз наоборот, если предположить, что там есть нуклеотид G, то тогда расстояние между правильными пиками будет неествественно маленьким, а также пик в данном случае все-таки значительно ниже, чем соседние Т и А.

Рис.7.А)В данном фрагменте программа поставила N на место 576 нуклеотида. В)Здесь этот же фрагмент на комплементарной обратной цепи, так как для этого секвенса это середина, то пике тут отчетливее, поэтому явно видно, что это нуклеотид G.